Кафедра прикладной математики
Доцент
Кандидат физико-математических наук
mkirillin@yandex.ru
Дела учебные
- Численные методы в биофотонике
Научная деятельность
Избранные публикации
Books and book chapters
- A.V. Bykov, M.Yu.Kirillin, A.V. Priezzhev, “Monte Carlo simulation of light propagation in human tissues and noninvasive glucose sensing”, Chapter 3 in Handbook of Optical Sensing of Glucose in Biological Fluids and Tissues (Ed. – V.V.Tuchin), CRC Press, Boca Raton, London, New York, Washington, 2008, pp. 67-98.
- V. Gelikonov, G. Gelikonov, M. Kirillin, N. Shakhova, A. Sergeev, N. Gladkova, E. Zagaynova “Fiber-Based OCT: From Optical Design to Clinical Applications”, Chapter 16 in Handbook of Photonics for Biomedical Science (Ed. – V.V. Tuchin), CRC Press, Boca Raton, London, New York, Washington, 2010, pp. 423-444.
- М.Ю. Кириллин, И.И. Фикс, А.Р. Катичев, А.В. Горшков, В.П. Гергель, “Высокопроизводительные вычисления для задач оптической биомедицинской диагностики” в сборнике «Суперкомпьютерные технологии в науке, образовании и промышленности (третий выпуск)», ред. В.А. Садовничий, Г.И. Савин, Вл.В. Воеводин, М.: Издательство Московского университета, 2012. с. 222-229, ISBN 978-5-211-06345-7.
Publications in international peer-reviewed journals
2016
- Меллер А.Е., Мотовилова Т.М., Пантелеева О.Г., Кузнецов С.С., Стройкова К.И., Кондратьева О.А., Кириллин М.Ю., Шахова Н.М. “Неинвазивная диагностика неопухолевой патологии с использованием оптической когерентной томографии” Альманах клинической медицины, 203-212 (2016).
- P.D. Agrba and M. Yu. Kirillin, “Effect of temperature regime and compression in OCT-imaging of skin”, Photonics and Lasers in Medicine, 5(2), 161-168 (2016). DOI: 10.1515/plm-2015-0044.
- D.A. Loginova, E.A. Sergeeva, A.D. Krainov, P.D. Agrba, M.Yu. Kirillin, “Liquid optical phantoms mimicking spectral characteristics of laboratory mouse biotissues”, Quantum Electronics, 46(6), 528–533 (2016).
2015
- Е.В. Губарькова, Е.Б. Киселева, М.Ю. Кириллин, Л.Б. Тимофеева, С.С. Кузнецов, Ф.И. Фельдштейн, Н.Д. Гладкова “Количественная оценка поляризационных характеристик атеросклеротических бляшек коронарных артерий на разных стадиях развития” Современные технологии в медицине, 7(4), 39-49 (2015).
- A.V. Gorshkov and M.Yu. Kirillin “Acceleration of Monte Carlo simulation of photon migration in complex heterogeneous media using Intel many-integrated Core Architecture”, J. Biomed. Opt, 20(8), 085002 (2015).
- M.Yu. Kirillin, E.A. Sergeeva, P.D. Agrba, A.D. Krainov, A.A. Ezhov, D.V. Shuleyko, P.K. Kashkarov, and S.V. Zabotnov, “Laser-ablated silicon nanoparticles: optical properties and perspectives in optical coherence tomography”, Laser Physics, 25, 075604 (2015). doi:10.1088/1054-660X/25/7/075604
- E. Kiseleva, M. Kirillin, F. Feldchtein, A. Vitkin, E. Sergeeva, E. Zagaynova, O. Streltzova, B. Shakhov, E. Gubarkova, and N. Gladkova, “Differential diagnosis of human bladder mucosa pathologies in vivo with cross-polarization optical coherence tomography” Biomedical Optics Express, 6(4), 1464-1476 (2015) doi:10.1364/BOE.6.001464.
- Пантелеева О.Г., Кузнецова И.А., Качалина О.В., Елисеева Д.Д., Гребенкина Е.В., ГамаюновС.В., Кузнецов С.С., Юнусова Е.Э., Губарькова Е.В., Кириллин М.Ю., Шахова Н.М. «Оптическая когерентная томография как инструмент в репродуктивной гинекологии», Современные технологии в медицине, 7(1), 89-96 (2015)
- I.L. Shlivko, M.Yu. Kirillin, E.V. Donchenko, D.O. Ellinsky, O.E. Garanina, M.S. Neznakhina, P.D. Agrba, V.A. Kamensky “Identification of layers in optical coherence tomography of skin: comparative analysis of experimental and Monte Carlo simulated images”, Skin Research and Technology, 21(4), 419-425 (2015). DOI: 10.1111/srt.12209 (2015).
2014
- A. Meller, M. Shakhova, Y. Rilkin, A. Novozhilov, M. Kirillin and A. Shakhov “Optical coherence tomography in diagnosing inflammatory diseases of ENT” Photonics and Lasers in Medicine, 3(4), 323–330 (2014). DOI: 10.1515/plm-2014-0025
- M. Kirillin, P. Agrba, and V. Kamensky “Mechanical compression in cross-polarization OCT imaging of skin: in vivo study and Monte Carlo simulation”, Photonics and Lasers in Medicine, 3(4), 363–372 (2014). DOI: 10.1515/plm-2014-0015
- A.D. Krainov, P.D. Agrba, E.A. Sergeeva, S.V. Zabotnov, M.Yu. Kirillin, “Study of contrasting properties of nanoparticles for optical diffuse spectroscopy problems”, Quantum Electronics 44 (8), 757–762 (2014).
- Горшков А.В., Кириллин М.Ю., Гергель В.П. «Улучшенный метод Монте-Карло для моделирования распространения зондирующего излучения в задачах оптической диффузионной спектроскопии», Вестник нижегородского университета им. Н.И. Лобачевского. Математическое моделирование. Оптимальное управление, 1(1) 239-247 (2014).
- M.Yu. Kirillin, G. Farhat, E.A. Sergeeva, M.C. Kolios, and A. Vitkin “Speckle statistics in OCT images: Monte Carlo simulations and experimental studies”, Optics Letters, 39(12), 3472-3475 (2014)
- R. Su, M. Kirillin, E.W. Chang, E. Sergeeva, S.H. Yun, and L. Mattsson “Perspectives of mid-infrared OCT for inspection and micrometrology of industrial ceramics”, Optics Express, 22(13), 15804-15819 (2014).
- П.Д. Агрба, Е.А. Бакшаева, Д.О. Эллинский, И.Л. Шливко, М.Ю. Кириллин “Роль механической компрессии при визуализации кожи человека методом кросс-поляризационной оптической когерентной томографии”, Современные технологии в медицине, 6(1) 75-82 (2014).
- V. O. Korhonen, T. S. Myllylä, M.Yu. Kirillin, A. Popov, A. Bykov, A.V. Gorshkov, E.A. Sergeeva, M. Kinnunen, V. Kiviniemi, “Light propagation in near-infrared spectroscopy of the human brain”, IEEE Journal of Selected Topics in Quantum Electronics, 20(2), 7100310 (2014).
- I.L. Shlivko, V.A. Kamensky, M.Yu. Kirillin, P.D.Agrba, O. E. Garanina, M.S. Neznakhina, D.O. Ellinsky, A.S. Maksimova, and Е.V. Donchenko, “Noninvasive study of structural and functional features of neonatal skin”, Journal of Innovative Optical Health Sciences, 7(3), 1450006 (2014).
2013
- Е.В. Губарькова, М.Ю. Кириллин, Е.А. Сергеева, Киселева Е.Б., Снопова Л. Б., Проданец Н.Н., Шарабрин Е.Г., Шахов Е.Б., Немирова С.В., Гладкова Н.Д., “Кросс-поляризационная оптическая когерентная томография в оценке структуры атеросклеротической бляшки”, Современные технологии в медицине, 5(4), 24-34 (2013)
- А.Д. Крайнов, А.М. Мокеева, Е.А Сергеева, П.Д. Агрба, М.Ю. Кириллин, «Оптические свойства биотканей мыши и их оптических фантомов», Оптика и спектроскопия, 115(2), 47-54 (2013).
- Пантелеева О.Г., Зиновьев А.Н., Юнусова К.Э., Кириллин М.Ю. и Шахова Н.М. “Диагностические возможности оптической интроскопии в выявлении причин нарушения репродуктивного здоровья женщин”, Российский вестник акушера-гинеколога , 5, 53-57 (2013).
2012
- A.V. Gorshkov, M.Yu. Kirillin, “Monte Carlo simulation of brain sensing by optical diffuse spectroscopy”, Journal of Computational Science, 3, 498–503 (2012).
- R. Su, M. Kirillin, P. Ekberg, A. Roos, E. Sergeeva, L. Mattsson “Optical coherence tomography for quality assessment of embedded microchannels in alumina ceramic”, Optics Express, 20(4), 4603-4618 (2012).
- M. Kirillin, O. Panteleeva, E. Yunusova, E. Donchenko, and N. Shakhova “Criteria for pathology recognition in OCT of fallopian tubes“, Journal of Biomedical Optics, 17, 081413 (2012).
- О.Г. Пантелеева, Б.Е. Шахов, К.Э Юнусова, М.Ю. Кириллин и Н.М. Шахова «Оптическая интроскопия – новый метод диагностики в репродуктивной медицине», Вестник радиологии и рентгенологии, 4, 50-55 (2012)
2011
- M.A. Sirotkina, M.V. Shirmanova, M.L.Bugrova, V.V. Elagin, .P.D. Agrba, M.Yu. Kirillin, V.A. Kamensky, E.V. Zagaynova, “Continuous optical coherence tomography monitoring of nanoparticles accumulation in biological tissues”, Journal of Nanoparticle Research, 13(1), 283-291 (2011).
- И.И. Фикс, М.Ю. Кириллин, Е.А. Сергеева, И.В. Турчин, «Реконструкция положения объектов для диффузионной флуоресцентной томографии на основе гибридных моделей рассеяния света в биотканях», Известия ВУЗов. Радиофизика, 54(3), 219-233 (2011).
2010
- Е.А. Сергеева, А.Р. Катичев, М.Ю. Кириллин, “Формирование сигнала двухфотонной флуоресцентной микроскопии в условиях сильного рассеяния: теоретическое и численное моделирование”, Квантовая Электроника, 40(12), 1053–1061 (2010).
- Х.С.С. Сорвойя, Т.С. Мюллюля, М.Ю. Кириллин, Е.А. Сергеева, Р.А. Мюллюля, А.А. Элесуд, Ю. Никкинен, О. Тервонен, В. Кивиниеми, “Неинвазивный МРТ-совместимый волоконно-оптический прибор для функциональной рефлектометрии мозга человека в оптическом и ближнем ИК диапазонах”, Квантовая Электроника, 40(12), 1067-1073 (2010).
- M. Kirillin, I. Meglinski, V. Kuzmin, E. Sergeeva and R. Myllylä “Simulation of optical coherence tomography images by Monte Carlo modeling based on polarization vector approach”, Optics Express, 18(21), 21714-21724 (2010).
- M.Yu. Kirillin, P.D. Agrba and V.A. Kamensky “In vivo study of the effect of mechanical compression on formation of OCT images of human skin”, Journal of Biophotonics, 3(12), 752-758 (2010).
- М.Ю. Кириллин, П.Д. Агрба, М.А. Сироткина, М.В. Ширманова, Е.В. Загайнова, В.А. Каменский “Контрастирование структурных элементов кожи наночастицами в оптической когерентной томографии: количественная оценка”, Квантовая Электроника, 40(6), 525–530 (2010).
2009
- П.Д. Агрба, М.Ю. Кириллин, А.И. Абелевич, Е.В. Загайнова, В.А. Каменский, «Компрессия как метод повышения информативности оптической когерентной томографии биотканей», Оптика и спектроскопия, 107(6), 901-906 (2009).
- M.Yu. Kirillin, M.V. Shirmanova, M.A. Sirotkina, M.L. Bugrova, B.N. Khlebtsov and E.V. Zagaynova, “Contrasting properties of gold nanoshells and titanium dioxide nanoparticles for OCT imaging of skin: Monte Carlo simulations and in vivo study”, J.Biomed. Opt., 14, 021017 (2009).
2008
- I. Meglinski, M. Kirillin, V. Kuzmin and R. Myllylä, “Simulation of Polarization-Sensitive Optical Coherence Tomography images by Monte Carlo method”, Optics Letters, 33(14), 1581-1583 (2008).
- E.V. Zagaynova, M.V. Shirmanova, M.Yu. Kirillin, B.N. Khlebtsov, A.G. Orlova, I.V. Balalaeva, M.A. Sirotkina, M.L Bugrova, P.D. Agrba and V.A. Kamensky, “Contrasting properties of gold nanoparticles for optical coherence tomography: phantom, in vivo studies and Monte Carlo simulation”, Phys. Med. Biol., 53, 4995-5009 (2008).
- М.Ю. Кириллин, А.В. Быков, А.В. Приезжев, Р. Мюллюля «Использование временного стробирования при измерении уровня глюкозы в трехслойной модели биоткани с помощью сверхкоротких лазерных импульсов», Квантовая Электроника, 38(5), 486-490 (2008).
- М.Ю. Кириллин, А.В. Приезжев, Р. Мюллюля ”Роль многократного рассеяния при формировании ОКТ изображений кожи”, Квантовая Электроника, 38(6), 570-575 (2008).
2007
- Е.В. Загайнова, М.В. Ширманова, В.А. Каменский, М.Ю. Кириллин, А.Г. Орлова, И.В. Балалаева, Б.Н. Хлебцов, А.М. Сергеев, ”Исследование контрастирующих свойств золотых наночастиц для метода ОКТ”, Российские Нанотехнологии, 2 (7-8), 135-143 (2007).
- M.Yu. Kirillin, E. Alarousu, T. Fabritius, R. Myllylä and A.V. Priezzhev “Visualization of paper structure by optical coherence tomography: Monte Carlo simulations and experimental study”, Journal of the European Optical Society – Rapid Publications, 2, 07031 (2007).
2006
- А.В. Быков, М.Ю. Кириллин, А.В. Приезжев, Р. Мюллюля, “Моделирование сигнала пространственно-разрешенной рефлектометрии от трехслойной среды с сильным рассеянием применительно к проблеме определения содержания глюкозы в коже человека”, Квантовая Электроника, 36 (12), 1125-1130 (2006).
- Е.А. Сергеева, М.Ю. Кириллин, А.В. Приезжев, «Распространение фемтосекундного импульса в рассеивающей среде: теоретический анализ и численное моделирование», Квантовая Электроника, 36 (11), 1023-1031 (2006).
- А.В. Быков, М.Ю. Кириллин, А.В. Приезжев, «Монте-Карло моделирование сигналовоптического когерентного томографа и его доплеровского варианта от модельных биологических тканей», Оптика и спектроскопия, 101 (1), 37-43 (2006).
- М.Ю. Кириллин, А.В. Приезжев, М.С. Федосеева, «Анализ вкладов различных кратностей рассеяния в сигнал оптического когерентного томографа от слоя крови методом Монте-Карло», Вестник МГУ.сер.3. Физика. Астрономия, No2, 36-40 (2006).
- M.Ю. Кириллин, И.В. Меглинский, А.В. Приезжев, «Влияние кратностей рассеяния на формирование сигнала в оптической низко-когерентной томографии сильно рассеивающих сред», Квантовая электроника, 36(3), 247-252 (2006).
- М.Ю. Кириллин, А.В. Приезжев, Ю.Хаст, Р.Мюллюля, «Оптическое просветление бумаги в оптической когерентной томографии: Монте-Карло моделирование», Квантовая электроника, 36(2), 174-180 (2006).
2005
- А.В. Быков, М.Ю. Кириллин, А.В. Приезжев, «Восстановление профиля скоростей потока суспензии, погруженного в светорассеивающую среду, по сигналу оптического когерентного доплеровского томографа (Монте-Карло моделирование)», Квантовая электроника, 35(11), 1079-1082 (2005).
- M.Yu. Kirillin, A.V. Priezzhev, V.V. Tuchin, R.K. Wang and R. Myllylä “Effect of red blood cell aggregation and sedimentation on optical coherence tomography signals from blood samples”, J. Phys. D: Appl. Phys. 38 , pp. 2582-2589 (2005)
- А.В. Быков, М.Ю. Кириллин, А.В. Приезжев. Монте-Карло моделирование сигнала оптического когерентного доплеровского томографа: влияние концентрации частиц в потоке на восстановленный профиль скоростей, Квантовая электроника, 35, 135-139 (2005).
2002
- М.Ю. Кириллин, А.В. Приезжев, “Монте-Карло моделирование распространения лазерного пучка в плоском слое суспензии эритроцитов. Сравнение вкладов различных кратностей рассеяния в угловое распределение света“, Квантовая электроника, 32(10), 883-887 (2002).